Em 1985, durante a vigência da reserva do mercado de informática, não se vislumbrava com clareza o futuro da tecnologia no Brasil.

Nesse contexto, a Diretoria-Executiva da Embrapa firmou convênio com o Centro Tecnológico para Informática - CTI, que era vinculado à Secretaria Especial de Informática - SEI, da Presidência da República, com o objetivo de desenvolver o projeto denominado Fábrica de Software.

Foi criado, assim, o Núcleo Tecnológico para Informática Agropecuária - NTIA, funcionando nas instalações do CTI, atual Centro Nacional de Pesquisas Renato Archer - CenPRA.

O projeto Fábrica de Software foi estruturado sob a forma de consórcio, do qual participavam o CTI, a Embrapa através do NTIA e o Banco do Brasil. Seu objetivo era aumentar a produção e a qualidade do software, por meio da implantação de metodologias e de ferramentas baseadas nos conceitos mais modernos de engenharia de software, disponíveis internacionalmente mas ainda não aplicados no País.

Um dos primeiros resultados foi o SOC - Software Científico, um software para gerenciamento e análise de dados e operações matemáticas.

Em termos de pioneirismo, vale lembrar que o NTIA foi a primeira unidade da Embrapa a utilizar o sistema operacional Unix e a reconhecer a importância da comunicação de dados pela internet (desde 1988 a unidade utiliza correio eletrônico).

Em 1993, o Núcleo recebeu status de centro nacional e transformou-se no atual Centro Nacional de Pesquisa Tecnológica em Informática para a Agricultura - CNPTIA. Nesse ano foi celebrado convênio com aUniversidade Estadual de Campinas - Unicamp, para a cessão de uso de terreno na Cidade Universitária Zeferino Vaz, onde seria construída a futura sede da unidade, com recursos do Banco Interamericano deDesenvolvimento - BID, no âmbito do Programa de Modernização Tecnológica da Agropecuária - Promoagro.

No início de 1996, a inauguração da sede própria da unidade representoua consolidação da infra-estrutura adequada para desenvolvimento dostrabalhos de pesquisa. Ainda em 1996, em decorrência da implantação dapolítica de comunicação da empresa e com o objetivo de fortalecer amarca Embrapa, foram criadas as assinaturas-sínteses das unidades e oCNPTIA passou a ser denominado Embrapa Informática Agropecuária.

Atualmente, é um centro de referência no desenvolvimento de projetos emtecnologia de informação aplicada ao agronegócio e atua nas áreas deengenharia de sistemas de software, computação científica, tecnologia decomunicação, bioinformática e agroclimatologia, priorizando o uso depadrões abertos e o desenvolvimento de sistemas para a web. Paraconsolidar sua atuação na execução de atividades de pesquisa e nadifusão do conhecimento gerado, estabeleceu parcerias com centros de pesquisa nacionais e internacionais, universidades, agências dedesenvolvimento e organizações não-governamentais.